topic Re: PHREG output statement question in SAS Procedures https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81938#M23582 <HTML><HEAD></HEAD><BODY><P>Someone can correct me if I am wrong, but I believe it is displaying the conditional survival probability.&nbsp; Here is a simple example:</P><P></P><P>Time&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Num. Events&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Num. Censored&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Num. at risk&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Survival</P><P>0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.00</P><P>1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.00&nbsp;&nbsp; </P><P>2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6/7 = 0.86</P><P>3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.86*5/6 = 0.71</P><P>4&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.71*2/3 = 0.48</P><P>5&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.48 * 1/2 = 0.24</P><P>6&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ------------</P><P></P><P></P><P>Survival is calculated as:</P><P>Survival<I> = Survival[i-1] * (Num. at risk<I>) - (Num. Events<I>) / (Num. at risk<I>)</I></I></I></I></P><P></P><P>See if this reproduces what you get.</P></BODY></HTML> Tue, 27 Nov 2012 18:55:38 GMT djbateman 2012-11-27T18:55:38Z PHREG output statement question https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81937#M23581 <HTML><HEAD></HEAD><BODY><P>In phreg, using the output statement with survival=<BR />option, what is the formula to recreate the survival= calculation?&nbsp; I cannot recreate it.</P><P></P><P></P><P>Thank you very much!</P></BODY></HTML> Tue, 27 Nov 2012 15:56:19 GMT https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81937#M23581 msecic 2012-11-27T15:56:19Z Re: PHREG output statement question https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81938#M23582 <HTML><HEAD></HEAD><BODY><P>Someone can correct me if I am wrong, but I believe it is displaying the conditional survival probability.&nbsp; Here is a simple example:</P><P></P><P>Time&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Num. Events&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Num. Censored&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Num. at risk&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Survival</P><P>0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.00</P><P>1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.00&nbsp;&nbsp; </P><P>2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6/7 = 0.86</P><P>3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.86*5/6 = 0.71</P><P>4&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.71*2/3 = 0.48</P><P>5&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.48 * 1/2 = 0.24</P><P>6&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ------------</P><P></P><P></P><P>Survival is calculated as:</P><P>Survival<I> = Survival[i-1] * (Num. at risk<I>) - (Num. Events<I>) / (Num. at risk<I>)</I></I></I></I></P><P></P><P>See if this reproduces what you get.</P></BODY></HTML> Tue, 27 Nov 2012 18:55:38 GMT https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81938#M23582 djbateman 2012-11-27T18:55:38Z Re: PHREG output statement question https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81939#M23583 <HTML><HEAD></HEAD><BODY><P>from PHREG I get the betas and HRs, I thought i would use a function of the betas, but I'm not sure exactly what function to use.</P><P></P><P>Thanks!</P></BODY></HTML> Tue, 27 Nov 2012 19:04:30 GMT https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81939#M23583 msecic 2012-11-27T19:04:30Z Re: PHREG output statement question https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81940#M23584 <HTML><HEAD></HEAD><BODY><P>I don't understand if you have a continuing question or are just making a comment.&nbsp; You are getting the betas and HRs in the survival= variable?&nbsp; When you use the output statement, you specify an output dataset (out=) and a name for the survival variable (survival=).&nbsp; That out= dataset will be stored in your work library, but you will still get parameter estimates and hazard ratios output to your SAS output (or wherever your preferences are set to put it).</P></BODY></HTML> Tue, 27 Nov 2012 19:10:46 GMT https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81940#M23584 djbateman 2012-11-27T19:10:46Z Re: PHREG output statement question https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81941#M23585 <HTML><HEAD></HEAD><BODY><P>I'm trying to use the betas from the model, plug in the individual patient data into a formula with the betas and try to recreate the exact values that I get in the survival=</P></BODY></HTML> Tue, 27 Nov 2012 19:18:00 GMT https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81941#M23585 msecic 2012-11-27T19:18:00Z Re: PHREG output statement question https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81942#M23586 <HTML><HEAD></HEAD><BODY><P> I want to use this, but what do I plug in for alpha?</P><P></P><P><SPAN style="font-family: TT1689o00; font-size: 10pt;">h</SPAN><SPAN style="font-family: TT1690o00; font-size: 7pt;">i</SPAN><SPAN style="font-family: TT168Ao00; font-size: 10pt;">(</SPAN><SPAN style="font-family: TT1689o00; font-size: 10pt;">t</SPAN><SPAN style="font-family: TT168Ao00; font-size: 10pt;">) = exp(</SPAN><SPAN style="font-family: TT1689o00; font-size: 10pt;">α </SPAN><SPAN style="font-family: TT168Ao00; font-size: 10pt;">+ </SPAN><SPAN style="font-family: TT1689o00; font-size: 10pt;">β</SPAN><SPAN style="font-family: TT168Fo00; font-size: 7pt;">1</SPAN><SPAN style="font-family: TT1689o00; font-size: 10pt;">x</SPAN><SPAN style="font-family: TT1690o00; font-size: 7pt;">i</SPAN><SPAN style="font-family: TT168Fo00; font-size: 7pt;">1 </SPAN><SPAN style="font-family: TT168Ao00; font-size: 10pt;">+ </SPAN><SPAN style="font-family: TT1689o00; font-size: 10pt;">β</SPAN><SPAN style="font-family: TT168Fo00; font-size: 7pt;">2</SPAN><SPAN style="font-family: TT1689o00; font-size: 10pt;">x</SPAN><SPAN style="font-family: TT1690o00; font-size: 7pt;">ik </SPAN><SPAN style="font-family: TT168Ao00; font-size: 10pt;">+ </SPAN><SPAN style="font-family: TT168Bo00; font-size: 10pt;">・ ・ ・<SPAN style="font-family: TT168Ao00; font-size: 10pt;">+ </SPAN><SPAN style="font-family: TT1689o00; font-size: 10pt;">β</SPAN><SPAN style="font-family: TT1690o00; font-size: 7pt;">k</SPAN><SPAN style="font-family: TT1689o00; font-size: 10pt;">x</SPAN><SPAN style="font-family: TT1690o00; font-size: 7pt;">ik</SPAN><SPAN style="font-family: TT168Ao00; font-size: 10pt;">)</SPAN></SPAN></P></BODY></HTML> Tue, 27 Nov 2012 19:19:28 GMT https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81942#M23586 msecic 2012-11-27T19:19:28Z Re: PHREG output statement question https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81943#M23587 <HTML><HEAD></HEAD><BODY><P>I am afraid that this becomes outside of my scope.&nbsp; I have actually been trying to figure out the same thing.&nbsp; I don't know if we can do it by hand.&nbsp; I hope someone else out there on the discussion board can help out.</P></BODY></HTML> Tue, 27 Nov 2012 19:30:23 GMT https://communities.sas.com/t5/SAS-Procedures/PHREG-output-statement-question/m-p/81943#M23587 djbateman 2012-11-27T19:30:23Z